Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
1700012A03RikQ9DAF1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
1700012A03RikQ9DAF1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
1700012A03RikQ9DAF1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
1700012A03RikQ9DAF1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
1700012A03RikQ9DAF1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms