Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmem239Q9DA47 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Tmem239Q9DA47 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Tmem239Q9DA47 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem239Q9DA47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms