Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd9Q9D9M4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Pdzd9Q9D9M4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd9Q9D9M4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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