Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp12Q9D9M2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp12Q9D9M2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms