Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms