Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl4Q9D8E6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl4Q9D8E6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms