Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4bQ9D8B3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms