Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn9Q9D805 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms