Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp5Q9D7S9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp5Q9D7S9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms