Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrps9Q9D7N3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrps9Q9D7N3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms