Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7G0

Prps1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1Q9D7G0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prps1Q9D7G0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms