Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn23Q9D7D7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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