Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc94Q9D6J3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms