Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rab11fip1Q9D620 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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