Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PudpQ9D5U5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms