Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D454 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D454 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D454 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D454 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms