Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap53Q9D439 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap53Q9D439 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms