Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp5Q9D387 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms