Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig1Q9D2J4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms