Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yif1bQ9CX30 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms