Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms