Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms