Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Raver1Q9CW46 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Raver1Q9CW46 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raver1Q9CW46 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms