Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINDY3Q9CV28 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms