Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sycp2Q9CUU3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms