Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms