Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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