Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snw1Q9CSN1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms