Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms