Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn2Q9CQS6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms