Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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