Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms