Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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