Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rab5aQ9CQD1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rab5aQ9CQD1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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