Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sar1bQ9CQC9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sar1bQ9CQC9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms