Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpa3Q9CQ71 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms