Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ncbp2Q9CQ49 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncbp2Q9CQ49 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms