Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CPS8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CPS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CPS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms