Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms