Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf8Q99PV0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms