Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms