Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl3Q99N95 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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