Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf17Q99MV7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms