Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms