Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms