Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gps1Q99LD4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms