Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TriobpQ99KW3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TriobpQ99KW3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms