Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lactb2Q99KR3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms