Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dok4Q99KE3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms