Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms